承上集結局，Nick Fury用傳呼機發訊息向Captain Marvel求救。Captain Marvel飛向宇宙邊陲將Tony救返地球。故事開端由Thanos殲滅地球一半生物體之後的廿三天開始。Captain Marvel領軍找尋Thanos並向他作出復仇。Thanos在一神秘星體過退休生活。因他已完成大業，他將六顆寶石全毁。但代價是身受重偒。Captain Marvel軍隊試圖奪取寶石手套，但因六顆寶石全毁，Thor盛怒之下一斧砍下將Thanos首級斬掉。

地球殲滅五年後蟻俠在一廢車場有幸從量子領域中逃出來。方知發現自己在量子領域五小時，在外世界已過五年。發現Thanos殲滅地球一事後找上Captain America。道出可以從量子世界打開一個時空缺口，往返不同時空。Captain America領軍找回剩下的復仇生還者。計劃將過去時空中寶石收集回來現今世界，重新鑄造新的寶石手套，將五年前地球一半生物體回復到現今世界。

戰敗的獅子是需要母愛才可回復昔日之勇
Thor因在五年前無功而回，終日酗酒渡日。他試圖返回過去找回其一寶石，遇見在世的母親。皇后知他是從未來世界的兒子，明白他過去受到失敗而壯志消沉。一番鼓勵下激發起昔日雄風。令他明白當務之急是要拯救世人。現實生活中女朋友或老婆都可以充當母親位置，因男人不是戰無不勝的雄獅。

遇上實力比自己相約或更強大之對手使詐是必然
Captain America返回復仇者第一集Loki被捕後，因要奪回權丈中的寶石，跟同是過去的Captain America進行一次爭奪戰。因大家都是Captain America，未來的Captain America心知再打數百回合，都不可能分出勝負。最後未來的Captain America說出Winter Soldier Bucky還是生存中，令過去版Captain America心神仿佛。最後未來的Captain America一拳擊暈過去版Captain America。
因Nebula要返回過去世界找尋寶石，她腦中的電腦記憶體跟過去世界的Nebula作出同步備份。因而過去世界中的Thanos得知未來世界中的復仇者聯盟會收集六顆寶石。片尾過去版的Thanos回到現今世界重奪寶石手套。這次手套是由Iron Man開發的。當Thanos重奪寶石手套再響手指。方發現手套的磁性失效，寶石飛向Iron Man鐵腕上。因Iron Man看準Thanos只會看管手套，但忽視手套是具有磁貼功能。當手套的磁貼功能關閉時，寶石全數掉下。這都是孫子兵法第一章中的兵不厭詐之奧義。

碎片預言方可留傳於世
被拯救後的Dr Strange回歸後第一句向Iron Man道出，If I tell you what happens, it won't happen。上集他在一千四百萬個預視中，只有一個預視是可以戰勝Thanos。因如他說出完善拯救方案，這個預視會由往後支路而改變方向。世人如向神明尋求未來答案，如求乩問事。祖師爺只會道出碎片預言方案，信徒單憑這些零碎方案再努力方可成功。如祖師爺全盤說出，只會令信徒不善生產。等待成功的機會。但世人不知這些成功機緣，都是先由信徒持而恆之方可遇到。

平淡是福
片尾Captain America獨自歸還所有寶石返回從前世界。任務完成後他放棄回到現在。他選擇留在入伍時的世界，找回過去世界戀人Peggy Carter。因他在Captain America第一集中保證會在戰後回去找她。但因冰封關係而在她老去後才去見她。Captain America一直放不下這個結，因沒法遵守諾言而自責多年。現在有機會返回過去找回戀人共渡時光。Captain America沒有返回基地跟復仇者隊員會面，而選擇自行生活到老年再獨自步行到基地。他一人坐在長椅，等待着隊員找到他。他道出他享受了一輩子幸福。因過去世界根本沒有Captain America。他可以過着平凡人生活到老。Falcon問他這個世界需要一位Captain America。他將盾牌交給Falcon，並示意他是最佳人選。

電影最後沒有交待清楚Falcon，Winter Soldier，Loki，Scarlet Witch及Vision去向。 而Marvel Studios總裁Kevin Feige日前就回應了大家最關注的問題，就是劇集與電影的連繫，他表示：
「電視劇包括新的故事，同時會繼續未完的故事。這些將是MCU中的主要故事情節，包括我們將要製作的其他Disney+系列劇集以及未來的電影。」
所以大家再一次放心劇集會與電影完全連繫，至於故事的時間線是設置在那，就要等待官方進一步消息，Disney+將於11月12日上線，以上劇集陸續開拍！